Юън Макгрегър е роден на 31 март 1971 г. в Пърт, Шотландия, Великобритания. На 16 години се присъединява към местния театър. Родителите му го подкрепят, когато решава да напусне училище и да се отдаде на актьорството, отколкото да го гледат нещастен. Макгрегър заминава за Лондон, където учи три години театър в училището „Гилдхол”. Там негови състуденти са Даниел Крейг и Алистър Макгоуан.
Дебютира в телевизията през 1993 г. с „Family Style”, още същата година се появява и на голям екран в ”Being Human”. Точно преди да се дипломира приема да участва в сериала "Lipstick on Your Collar" (1993). Първата му по-голяма роля е в „Плитък гроб” (1994), от чиято снимачна площадка започва и съвместната му работа с Дани Бойл. На английския режисьор дължи големия си успех две години по-късно. През 1995 г. се жени за Ив Мавракис, от която има три деца. През 1996 г. Юън се снима отново при Бойл в хита „Трейнспотинг” - филмът, който го прави известен в целия свят. Същата година участва още в „Записки под възглавката” на Питър Грийнауей и „Ема”, в който се снима с Гуинет Полтроу, Тони Колет, Алън Къминг, Джереми Нортъм и др. Кариерата на Макгрегър продължава с бързо темпо. През 1997-ма се снима в „Nightwatch” с Патриша Аркет и Джош Бролин. Не минават и 12 месеца и той се появява отново в съвместен проект с Дани Бойл – казва се „Луд живот”.
След него застава до Бренда Блетин и Майкъл Кейн в „Звезден глас” (1998). През 1999 се снима при Лукас в първия от новите три серии на легендарната поредица - „Star Wars: Епизод І”. В годината, разделяща двете столетия, шотландецът се превръща в Джеймс Джойс във филма „Нора” (2000). През 2001- ва участва в мюзикъла на Баз Лурман „Мулен Руж” и във военния екшън на Ридли Скот „Блек хоук”. През 2002 г. Джордж Лукас снима „Star Wars: Епизод ІІ- клонираните атакуват”, където Макгрегър отново играе Оби Уан Кеноби. През 2003 - та се снима с Рене Зелуегър в ретро романтичната комедия с прекрасни костюми „Долу любовта” и в „Младият Адам” с Тилда Суинтън.
Успява да участва и в още един проект през същата година – „Голяма риба” на Тим Бъртън. През 2005 се появява в глупавия „Островът” с горещата Скарлет Йохансон и в последния създаден епизод от сагата „Междузвездни войни” – „Star Wars: Епизод ІІІ- Отмъщението на ситите”. Снима се отново с Рене в „Госпожица Потър” (2006). Следва участие във филма на Уди Алън „Cassandra’s Dream” (2007). След „Ангели и демони” ще го видим в лентата на Мира Наир „Amelia” (2009) и "Писател в сянка" (2010)